Klinika Pediatrii, Gastroenterologii prowadzi na chwilę obecną trzy programy lecznicze NFZ i Ministerstwa Zdrowia:

1. Program leczenia Infliximabem (IFX)

• choroba Leśniowskiego-Crohna
• wrzodziejące zapalenie jelita grubego

2. Program leczenia adalimumabem (ADA)

• choroba Leśniowskiego-Crohna

3. Program leczenia maralixibatem 

• zespół Alagille’a